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修験灌頂之大事

柱源秘底記 上中下

宗義決擇集 二十巻

中正論 二十巻(第八巻缺)序目一巻

福壽根基家寶全集 初集第一巻、四集第二至八巻ハ零本

三世演禽骨書

五字孝經 一巻(五葉)

太上三元妙經

大聖五公菩薩眞經 二三葉

關聖帝君救世血心論 一巻(四葉)

神訓旁註便讀

玄帝報恩經懴合編

警世晨鐘

釋氏書啓

倶舍論記 三十卷

倶舍論釋頌疏義鈔 三卷

倶舍論頌釋疏 二十九卷

倶舍頌疏記 二十九巻

倶舍論疏 巻一、二、四至七、十七

異部宗輪論述記 二巻

順正理論述文記 殘二卷 存卷第九第十八

法宗原

東叡山子院現住法脈記 三巻

大峰秘所私聞書

金峰山秘密伝並雑記

〈校訂〉金峰山秘密伝序例

金峰山秘伝

辨西方要決眞僞造疑

法相宗法門目録

律宗三大部篇目具書論義注文

律鈔宗要

大佛頂經問決

法蕐經啓運鈔 五十五巻

法蕐文句記講録 五十巻

傳通記糅鈔 四十八巻

成唯識論述記文集

因明四相違要文 三十五巻 第十四至十六、廿二至廿六、廿八至卅一巻缺

五教章通路記 全五十二巻(第一巻首、五、七、九、二十二、二十八至三十三、三十五至三十七、五十二巻缺)

蕐嚴一乘教分記輔宗匡眞鈔 十巻

柱源灌頂備要記案