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大乘法界無差別論 一卷

大乘法界無差別論疏

大乘法界無差別論疏 二卷

徑中經又徑 四卷

大佛頂如來密因修證了義諸菩薩萬行首楞嚴經通議 十卷 懸鏡 一卷 補遺 一卷

大佛頂如來密因修證了義諸菩薩萬行首楞嚴經玄義 二卷

思益梵天所問經簡註 四卷

金剛頂瑜伽略逑三十七尊心要 一卷

修設瑜伽集要施食壇儀 一卷

修設瑜伽集要施食壇儀 一卷

釋摩訶衍論 十卷

集一切福徳三昧經 殘一卷 存卷下

佛説千手千眼觀世音菩薩廣大圓滿無礙大悲心陀羅尼經 一卷

大毗盧遮那經廣大儀軌 三卷

大毗盧遮那經供養次第法疏 二卷

大毘盧遮那佛説要略念誦經 一卷

大毗盧遮那成佛神變加持經義釋演密鈔 十卷

大毗盧遮那成佛經疏 二十卷

都表如意摩尼轉輪聖王次第念誦祕密㝡要略法 一卷

金剛錍顯性録 四卷

三聖圓融觀門 一卷

大乘義章 二十卷

大乘法苑義林章 七卷

大部妙玄格言 二卷

二諦義 三卷

靈峰蕅益大師宗論 十卷

金剛頂經大瑜伽祕密心地法門義訣 卷上

祕密儀軌

毗盧遮那成佛神變加持經義釋 十四卷

佛頂心陀羅尼經 三卷

不動尊愚鈔 一卷

摩尼燭坤集要

瑜伽施食儀觀 一卷

御選雲棲蓮池[コウ]大師語録 一卷 即 御選語録卷第十三

永覺和尚禪餘外集 八卷

永覺和尚洞上古轍 二卷

永覺和尚洞上古轍 二卷

慧覺衣禪師語録 二卷

永明道跡 一卷

筠州黄檗山斷際禪師傳心法要 二卷